在拉让江流域，这个刚成立的社群占据了诗巫旁边丛林中的一小块空地；富雅各要牧养他们，将会面对艰难的挑战。因为这里基础建设和设施匮乏，这些侨民一方面要辛勤地种稻米糊口，另一方面还要预防各种肆虐的热带疾病。由于原住民的土地受到侵占，华侨农民与当地达雅族人的关系，也持续在仇视与紧张中。
正当此时，富雅各与所牧养的人之间的沟通也困难重重。他在槟城时学会了一些马来话，也学到少许的福建方言；而现在却要开始学福州话。他也要面对思乡和孤寂的情绪；还好这种种情绪在1904年与杨玛莉(Mary Young)结婚之后，就得到大大的改善了。
虽然如此，他仍然全心投入服事，向当地的侨胞教导圣经真理，鼓励华人家庭在信仰上忍耐、坚持，又训练年轻人以平信徒的身分讲道。他相信宣教工作不只在于属灵方面的教导，他们夫妇俩更是花很多时间来照顾居民的实际生活需要。他知道他不但要支持当地居民奔走信心的旅程，更要改善他们的社会和经济生活，这两者是密不可分的。于是，他们帮助村民建立男校和女校，建筑房屋和公路，又想办法增加他们的农作收成。
事实上，富雅各三十多年在拉让江沿岸的服事过程中，已经建立了开拓先锋和牧者的名声。他在运输、农业、教育和通讯方面都引进了很多个“第一”。这长长的名单包括第一辆脚踏车、第一艘汽船，协助农民运输农产品；第一粒橡胶种子和第一台电动碾米机；第一间女校、第一间农业学校、第一部制冰机、电锯、发电机和无线电报机。有一次他说：“除了我所建立的教堂和学校、以及与上帝同工来帮助人改变生命，我最引以为豪的就是我的船只。”
富雅各还扮演了地方仲裁之类的角色，也是华人与达雅族(他后来赢得他们的尊重)之间的纠纷调停者，还成为福州华人与英国殖民地官员的中间人。1904年，英国殖民地官员委任他为“福州人的维护者”，这个职衔有利于他接触相关的官员并处理事务，例如为侨民争取更多土地等等。他最大的荣誉是受华人社会称他为“富先生”，当地马来人也称呼他为Tuan Hoover；反映出富雅各在牧养上帝羊群的同时，也得着当地人无比的尊重与爱戴。
1935年富雅各死于疟疾。那时，他们夫妇俩已建立了41间堂会和40间学校，有超过千名儿童受洗和受教育。他所牧养的那小村子原本只有500人，如今已发展成有数千人居住的现代化社区、有引以为豪的学校、自立自足的教会，还有数以万计英亩的农耕地，这些部分要归功于富雅各帮助福州华人发展社会和经济的决心。
在今天的砂拉越和沙巴有超过120间卫理公会堂会，以及超过六万名敬拜者。这些信徒们代表着他所留下的传承，他沉着的决心、安静忍耐、忠心顺服主耶稣的命令，到地极成为祂的见证。从宾夕凡尼亚州的一个小镇到砂拉越丛林里的小空地，富雅各凭著信心迈出每一个小步伐，让上帝呼召的确据在心里生根，并以一切所有的来回应。就算遭逢艰难的处境，他依旧坚持到底，从不偏离上帝差派他去做的工作。
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